De oorzaken van zwangerschapsmisselijkheid zijn divers: hormonale factoren, schildklierstimulering, een voorgeschiedenis van migraine of reisziekte, of een tekort aan B-vitaminen. Sommige theorieën suggereren ook dat het lichaam je probeert te beschermen tegen mogelijk schadelijk voedsel door misselijkheid op te wekken bij bepaalde geuren of smaken. Ook overmatige speekselproductie tijdens de zwangerschap kan misselijkheid veroorzaken.